Pregled proteina, molekulskih masa i podjedinica
1
Sveu
č
ilište u Splitu
Prirodoslovno-matemati
č
ki fakultet
Odjel za kemiju
Odjel za kemiju
prof. dr. sc. Maja Pavela-Vran
č
i
č
1
biopolimeri
razlikuju se po veli
č
ini, ustroju i
obliku molekule
mioglobin
Gro EL
2
struktura proteinske molekule
odre
đ
uje njezinu funkciju
imunoglobulin
kolagen
2
prijenos i pohrana (hemoglobin i mioglobin)
i
k k t li
enzimska kataliza
koordinirano kretanje (miši
ć
ni proteini)
imunološka zaštita (imunoglobulini)
hormonska regulacija (somatotropin, inzulin)
3
mehani
č
ka
č
vrsto
ć
a (kolagen)
stvaranje i provo
đ
enje živ
č
anih impulsa (receptori)
kontrola ekspresije gena (represori, aktivatori)
Proteini se sastoje od jednog (
monomerni
proteini) ili
više (
multimerni
proteini) polipeptidnih lanaca
Multimerni proteini
s jednom vrstom podjedinice:
homomultimeri
Protein
Mr
(Da)
Pod-
jedinice
lizozim (bjelanjka)
13930
1
serumski albumin
(humani)
68500
1
-globulin (konja)
149000
2
2
s više vrsta podjedinica:
heteromultimeri
lizozim
4
Dalton (Da):
jedinica mase proteina - gotovo jednaka masi atoma vodika (1.000)
glutamat
dehidrogenaza
(jetrena)
332694
6
glutamin sintetaza
(
E. coli
)
600000
12
-globulin
glutamin sintetaza

4
Nekovalentne interakcije
vodikove veze
Stabilizacija
proteinske strukture
N–H …… O=C<
ionske veze
-NH
3
+
…….
–
OOC-
hidrofobne interakcije
-CH
3
……H
3
C-
7
koordinacija ionima
metala
.…… Me
2+
……..
Disulfidna
veza je
kovalentna
veza kojom je stabilizirana
struktura mnogih proteina
Disulfidna
veza
struktura mnogih proteina
nastaje oksidacijom SH-skupine u bo
č
nim ograncima
dvaju
cisteina
unutar istog ili razli
č
itih lanaca
bo
č
ni ogranak
cisteina
disulfidna
veza
8
disulfidne
veze
imunoglobulin
lizozim
5
Proteini imaju jedinstvene aminokiselinske
sljedove koje odre
đ
uju geni
sljedove koje odre
đ
uju geni
D
E
E
R
K
K
V
V
V
V
V
V
A
A
A
A
A
M
I
P
L
L
T
T
N
G
G
G
amino kraj
karboksilni kraj
9
Primarna
Primarna
struktura je
struktura je
slijed
slijed
aminokiselina u polipeptidnom
aminokiselina u polipeptidnom
lancu od amino kraja prema karboksilnom kraju
lancu od amino kraja prema karboksilnom kraju
K
V
A
A
A
P
G
karboksilni kraj
Homologni proteini
su evolucijski srodni
proteini sli
č
ne primarne strukture i funkcije
Usporedba primarne
strukture homolognih
proteina
promjenjivi
aminokiselinski ostaci:
bez zna
č
aja za funkciju
protein
č
10
•
visokoo
č
uvani
aminokiselinski ostaci:
od specifi
č
nog zna
č
aja za
funkciju proteina
Usporedba primarne strukture
serinskih
proteaza

7
Anemija srpastih stanica
Klini
č
ki zna
č
aj primarne strukture:
mnoge nasljedne
bolesti uzrokovane su mutacijom tj. izmjenom jednog ili
više aminokiselinskih ostataka u proteinu
j
p
zamjena
: Glu A6
Val u
β
-lancu hemoglobina
HbA
Val-His-Leu-Thr-Pro-
Glu
-Glu-Lys-
HbS Val-His-Leu-Thr-Pro-
Val
-Glu-Lys-
β
1 2 3 4 5 6 7 8
13
Glu: polarna i nabijena aminokiselina
Val: nepolarna aminokiselina
Konformacija dijela polipeptidne
okosnice
-uzvojnica
klupko
14
-nabrana plo
č
a
okret
Ovaj materijal je namenjen za učenje i pripremu, ne za predaju.