Eugenol i njegovi bioaktivni derivati
Objavio MilicaD12 12. februar 2025.
Seminarski radovi, Skripte, Hemija
Objavio studenti.rs 26. mart 2018. Prijavi dokument
Poli-3-hidroksibutirat je čvrsti polimer velike molekulske mase, te je njegov transport kroz ćelijsku membranu onemogućen. Različite vrste mikroorganizama izlučuju ekstracelularnu PHB- depolimerazu koja hidrolizira čvrsti P(3HB) u vodotopive monomere i oligomere. Neke vrste P(3HB)-razgradivih mikroorganizama su izolirane iz raznih dijelova životne sredine, kao što su: zemlja, morska voda, voda iz jezera, zrak, gejziri i mulj. Ekstracelularni PHB koji su izolirani iz različitih mikroorganizama su na osnovu toga i karakterizirani. Izolirana PHB- depolimeraza sastoji se od jednog polipeptidnog lanca molekulske mase u rasponu 37000 – 60000. Analiza strukturnih gena PHB-depolimeraze pokazala je da se svi enzimi sastoje od: N-terminalne, katalitičke domene, C-terminalne, supstrat-vezujuće domene i mjesta spajanja koje povezuje dvije domene (slika 5). Postojanje i katalitičke i vezujuće domene potvrđeno je u mnogim depolimerizirajućim enzimima (poput celulaze, ksilanaze i hitinaze) koji hidroliziraju vodonetopive polisaharide.
Katalitička domena sadrži ”lipaza džep” (engl. lipase box) pentapeptida [Gly-X1-Ser-X2-Gly] kao aktivno mjesto sa OH grupom serina. Aktivno mjesto serina formira katalitičku trijadu uz aspartat i histidin, a prijelazni tetraedarski međuprodukt sa karbonilnim ugljikom stabiliziran je NH grupama koje se nalaze na histidinskim ostacima. Kao što je prikazano (slika 5), ekstracelularne PHB-depolimeraze su klasificirane u dvije vrste, na osnovu razlike u poziciji ”lipaza džepa” u katalitičkoj domeni. Enzimi vrste A, kod kojih je ”lipaza džep” smješten u centru katalitičke domene, zastupljeni su kod sljedećih mikroorganizama: Alcaligenes faecalis AE122, A. faecalis T1, Pseudomonas lemoignei PhaZ1, P. lemoignei PhaZ2, P. lemoignei PhaZ3, P. lemoignei PhaZ4, P. lemoignei PhaZ5 i Pseudomonas stutzeri. Enzimi B vrste, kod kojih je ”lipaza džep” u susjedstvu N-terminalnog kraja, zastupljeni su kod sojeva: Comamonas sp., C. acidovorans, C. teststeroni i Streptomyces exfoliatus. Navodi se da C-terminal služi kao vezujuća domena za vodonetopive P(3HB) supstrate. Razlog tome ogleda se u činjenici da PHB-depolimeraze gube sposobnost hidroliziranja vodonetopivih P(3HB) supstrata u odsustvu C-terminal domene, dok njena sposobnost hidroliziranja vodotopivih (R)-3HB oligomera biva očuvana. Također, mjesta spajanja koja povezuju katalitičku i C-terminal vezujuću domenu identificirana su u svim poznatim PHB- depolimerazama, a javljaju se u obliku fibronektina tipa III, treoninom bogatih područja ili u kaderin-sličnim domenama. Treba istaknuti da mjesta spajanja imaju važnu strukturnu ulogu, jer osiguravaju optimalnu udaljenost između katalitičke i supstrat-vezujuće domene.
Objavio MilicaD12 12. februar 2025.
Objavio Biljanae 07. novembar 2024.
Objavio pavle.najdenov 23. septembar 2024.
Objavio MilicaD12 12. februar 2025.
Objavio Avdas 11. februar 2025.
Objavio zver9 11. februar 2025.
Objavio MilicaD12 12. februar 2025.
Objavio boob1703 12. februar 2025.
Objavio boob1703 12. februar 2025.
Komentari
You must be logged in to post a comment.